Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms