Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA2

PATE1, Prostate and testis expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE1Q8WXA2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATE1Q8WXA2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATE1Q8WXA2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PATE1Q8WXA2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATE1Q8WXA2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PATE1Q8WXA2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PATE1Q8WXA2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PATE1Q8WXA2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PATE1Q8WXA2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PATE1Q8WXA2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATE1Q8WXA2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PATE1Q8WXA2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATE1Q8WXA2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATE1Q8WXA2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATE1Q8WXA2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATE1Q8WXA2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATE1Q8WXA2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATE1Q8WXA2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATE1Q8WXA2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PATE1Q8WXA2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATE1Q8WXA2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATE1Q8WXA2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATE1Q8WXA2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATE1Q8WXA2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms