Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C15orf40Q8WUR7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C15orf40Q8WUR7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C15orf40Q8WUR7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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