Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC7Q8WUI4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDAC7Q8WUI4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC7Q8WUI4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC7Q8WUI4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC7Q8WUI4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms