Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD6

CHPT1, Cholinephosphotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPT1Q8WUD6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPT1Q8WUD6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPT1Q8WUD6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPT1Q8WUD6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPT1Q8WUD6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHPT1Q8WUD6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPT1Q8WUD6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPT1Q8WUD6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPT1Q8WUD6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPT1Q8WUD6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPT1Q8WUD6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHPT1Q8WUD6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHPT1Q8WUD6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHPT1Q8WUD6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPT1Q8WUD6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPT1Q8WUD6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms