Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM1Q8TC05 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MDM1Q8TC05 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM1Q8TC05 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDM1Q8TC05 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms