Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC71Q8N4P6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC71Q8N4P6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC71Q8N4P6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC71Q8N4P6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC71Q8N4P6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC71Q8N4P6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC71Q8N4P6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC71Q8N4P6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC71Q8N4P6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC71Q8N4P6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC71Q8N4P6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC71Q8N4P6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC71Q8N4P6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC71Q8N4P6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC71Q8N4P6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms