Protein–RNA interactions for Protein: Q8N183

NDUFAF2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF2Q8N183 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NDUFAF2Q8N183 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDUFAF2Q8N183 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NDUFAF2Q8N183 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms