Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHERPQ8IWX8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHERPQ8IWX8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHERPQ8IWX8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHERPQ8IWX8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHERPQ8IWX8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHERPQ8IWX8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHERPQ8IWX8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHERPQ8IWX8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHERPQ8IWX8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHERPQ8IWX8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHERPQ8IWX8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHERPQ8IWX8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHERPQ8IWX8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHERPQ8IWX8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHERPQ8IWX8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHERPQ8IWX8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHERPQ8IWX8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHERPQ8IWX8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHERPQ8IWX8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHERPQ8IWX8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms