Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SKAP1Q86WV1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SKAP1Q86WV1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SKAP1Q86WV1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SKAP1Q86WV1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SKAP1Q86WV1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SKAP1Q86WV1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SKAP1Q86WV1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SKAP1Q86WV1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SKAP1Q86WV1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SKAP1Q86WV1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SKAP1Q86WV1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SKAP1Q86WV1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SKAP1Q86WV1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SKAP1Q86WV1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SKAP1Q86WV1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
SKAP1Q86WV1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SKAP1Q86WV1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SKAP1Q86WV1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SKAP1Q86WV1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms