Protein–RNA interactions for Protein: Q86UV7

TRIM73, Tripartite motif-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM73Q86UV7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM73Q86UV7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM73Q86UV7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM73Q86UV7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms