Protein–RNA interactions for Protein: Q86UG4

SLCO6A1, Solute carrier organic anion transporter family member 6A1, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO6A1Q86UG4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLCO6A1Q86UG4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO6A1Q86UG4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO6A1Q86UG4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLCO6A1Q86UG4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms