Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF550Q7Z398 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF550Q7Z398 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF550Q7Z398 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF550Q7Z398 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms