Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC11Q7Z392 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRAPPC11Q7Z392 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC11Q7Z392 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms