Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZD4Q76G19 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDZD4Q76G19 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDZD4Q76G19 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.4 ms