Protein–RNA interactions for Protein: Q719H9

KCTD1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD1Q719H9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCTD1Q719H9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCTD1Q719H9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
KCTD1Q719H9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCTD1Q719H9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCTD1Q719H9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCTD1Q719H9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCTD1Q719H9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCTD1Q719H9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KCTD1Q719H9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCTD1Q719H9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCTD1Q719H9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCTD1Q719H9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCTD1Q719H9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCTD1Q719H9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCTD1Q719H9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCTD1Q719H9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCTD1Q719H9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KCTD1Q719H9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCTD1Q719H9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCTD1Q719H9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCTD1Q719H9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCTD1Q719H9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCTD1Q719H9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCTD1Q719H9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCTD1Q719H9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCTD1Q719H9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCTD1Q719H9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCTD1Q719H9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCTD1Q719H9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCTD1Q719H9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCTD1Q719H9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCTD1Q719H9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCTD1Q719H9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCTD1Q719H9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCTD1Q719H9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KCTD1Q719H9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCTD1Q719H9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCTD1Q719H9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCTD1Q719H9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCTD1Q719H9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KCTD1Q719H9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCTD1Q719H9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KCTD1Q719H9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCTD1Q719H9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCTD1Q719H9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCTD1Q719H9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCTD1Q719H9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCTD1Q719H9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCTD1Q719H9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms