Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACAD11Q709F0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ACAD11Q709F0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACAD11Q709F0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACAD11Q709F0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACAD11Q709F0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACAD11Q709F0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAD11Q709F0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms