Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCBE1Q6UXH8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCBE1Q6UXH8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCBE1Q6UXH8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms