Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
LARP1Q6PKG0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
LARP1Q6PKG0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LARP1Q6PKG0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LARP1Q6PKG0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LARP1Q6PKG0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms