Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EMBQ6PCB8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EMBQ6PCB8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EMBQ6PCB8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EMBQ6PCB8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms