Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLFN13Q68D06 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLFN13Q68D06 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLFN13Q68D06 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLFN13Q68D06 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SLFN13Q68D06 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLFN13Q68D06 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLFN13Q68D06 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLFN13Q68D06 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLFN13Q68D06 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SLFN13Q68D06 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLFN13Q68D06 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLFN13Q68D06 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFN13Q68D06 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFN13Q68D06 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFN13Q68D06 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SLFN13Q68D06 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN13Q68D06 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN13Q68D06 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLFN13Q68D06 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLFN13Q68D06 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms