Protein–RNA interactions for Protein: Q5XLA6

CARD17, Caspase recruitment domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD17Q5XLA6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD17Q5XLA6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARD17Q5XLA6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CARD17Q5XLA6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms