Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4DIPQ5VU43 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE4DIPQ5VU43 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE4DIPQ5VU43 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE4DIPQ5VU43 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms