Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC183Q5T5S1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC183Q5T5S1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC183Q5T5S1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC183Q5T5S1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC183Q5T5S1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms