Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CT47A1Q5JQC4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CT47A1Q5JQC4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CT47A1Q5JQC4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CT47A1Q5JQC4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CT47A1Q5JQC4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CT47A1Q5JQC4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CT47A1Q5JQC4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CT47A1Q5JQC4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CT47A1Q5JQC4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CT47A1Q5JQC4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CT47A1Q5JQC4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CT47A1Q5JQC4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CT47A1Q5JQC4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CT47A1Q5JQC4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CT47A1Q5JQC4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CT47A1Q5JQC4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CT47A1Q5JQC4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CT47A1Q5JQC4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CT47A1Q5JQC4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CT47A1Q5JQC4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CT47A1Q5JQC4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CT47A1Q5JQC4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CT47A1Q5JQC4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CT47A1Q5JQC4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CT47A1Q5JQC4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CT47A1Q5JQC4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CT47A1Q5JQC4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CT47A1Q5JQC4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CT47A1Q5JQC4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.58■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CT47A1Q5JQC4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CT47A1Q5JQC4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CT47A1Q5JQC4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms