Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TAF1BQ53T94 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1BQ53T94 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1BQ53T94 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1BQ53T94 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms