Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC44A4Q53GD3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC44A4Q53GD3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A4Q53GD3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC44A4Q53GD3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms