Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPAT3Q53EU6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPAT3Q53EU6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAT3Q53EU6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms