Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFAP221Q4G0U5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP221Q4G0U5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms