Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CAMK4Q16566 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMK4Q16566 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAMK4Q16566 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMK4Q16566 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMK4Q16566 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms