Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SS18Q15532 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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SS18Q15532 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SS18Q15532 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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SS18Q15532 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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SS18Q15532 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SS18Q15532 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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SS18Q15532 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SS18Q15532 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SS18Q15532 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SS18Q15532 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SS18Q15532 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SS18Q15532 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SS18Q15532 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SS18Q15532 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SS18Q15532 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SS18Q15532 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SS18Q15532 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SS18Q15532 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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