Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBX1Q14549 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBX1Q14549 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBX1Q14549 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBX1Q14549 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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