Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SQLEQ14534 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SQLEQ14534 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SQLEQ14534 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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