Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAT1Q14517 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
FAT1Q14517 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAT1Q14517 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAT1Q14517 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAT1Q14517 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAT1Q14517 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAT1Q14517 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAT1Q14517 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAT1Q14517 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAT1Q14517 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAT1Q14517 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAT1Q14517 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms