Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPARCL1Q14515 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPARCL1Q14515 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPARCL1Q14515 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPARCL1Q14515 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPARCL1Q14515 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPARCL1Q14515 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPARCL1Q14515 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPARCL1Q14515 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SPARCL1Q14515 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPARCL1Q14515 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPARCL1Q14515 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPARCL1Q14515 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPARCL1Q14515 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPARCL1Q14515 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPARCL1Q14515 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 999.6 ms