Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1CQ13936 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1CQ13936 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1CQ13936 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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