Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX6Q13608 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX6Q13608 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX6Q13608 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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