Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIPK1Q13546 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK1Q13546 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIPK1Q13546 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIPK1Q13546 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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