Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 ORM1YGR038W 669 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 YKR012CYKR012C 378 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 CDA2YLR308W 939 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 CUS2YNL286W 858 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 TIF3YPR163C 1311 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 TRP1YDR007W 675 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 MSP1YGR028W 1089 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 REV7YIL139C 738 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 RSM7YJR113C 744 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 PCD1YLR151C 1023 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 YIP3YNL044W 531 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 PHA2YNL316C 1005 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 YBR089WYBR089W 600 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 POP4YBR257W 840 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 BRL1YHR036W 1416 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 LPD1YFL018C 1500 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 PMT7YDR307W 1989 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 SLM3YDL033C 1254 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 YNL140CYNL140C 570 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-NL1Q12391 INO1YJL153C 1602 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 HMRA1YCR097W 381 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 SKI6YGR195W 741 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 VBA3YCL069W 1377 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 SDS24YBR214W 1584 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 GLY1YEL046C 1164 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 ERP5YHR110W 639 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 CDD1YLR245C 429 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 MTG1YMR097C 1104 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 RAD17YOR368W 1206 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 MRN1YPL184C 1839 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 RKM4YDR257C 1485 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 SHE9YDR393W 1371 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 YPL068CYPL068C 882 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 SMF3YLR034C 1422 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 INM1YHR046C 888 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 YLR118CYLR118C 684 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 YNL226WYNL226W 411 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 CMK1YFR014C 1341 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 TGL5YOR081C 2250 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 MPC54YOR177C 1395 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 LRO1YNR008W 1986 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 YCR006CYCR006C 474 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 YDL121CYDL121C 450 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 POP5YAL033W 522 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 PFA4YOL003C 1137 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 ATG19YOL082W 1248 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 ALR1YOL130W 2580 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 CHA1YCL064C 1083 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 MRPL32YCR003W 552 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 PCL9YDL179W 915 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 GLC8YMR311C 690 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 CSL4YNL232W 879 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 ALG5YPL227C 1005 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 PTC4YBR125C 1182 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 PAF1YBR279W 1338 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-NL1Q12391 DIN7YDR263C 1293 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 SSU72YNL222W 621 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 DIP5YPL265W 1827 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 MCM21YDR318W 1107 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 MRP1YDR347W 966 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 ADH4YGL256W 1149 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 PHB2YGR231C 933 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 TDA4YJR116W 840 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 XPT1YJR133W 630 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 ADH3YMR083W 1128 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 YDR029WYDR029W 315 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 YFR020WYFR020W 699 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 COG7YGL005C 840 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 MRP13YGR084C 1020 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 SPO12YHR152W 522 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 SUI2YJR007W 915 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 PPA2YMR267W 933 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 MTQ1YNL063W 945 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 MET13YGL125W 1803 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 WSC4YHL028W 1818 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 YDR541CYDR541C 1035 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 AIM34YMR003W 597 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 RNH1YMR234W 1047 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 MRP7YNL005C 1116 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 ARL3YPL051W 597 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 NCE102YPR149W 522 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 ENO1YGR254W 1314 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 EHT1YBR177C 1356 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 TOM71YHR117W 1920 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 CPD1YGR247W 720 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 OPI1YHL020C 1215 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 ARG3YJL088W 1017 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 MGM101YJR144W 810 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 IZH4YOL101C 939 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 CTF18YMR078C 2226 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 MET30YIL046W 1923 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 PEX7YDR142C 1128 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 YNL190WYNL190W 615 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-NL1Q12391 OST3YOR085W 1053 nt7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 159.6 ms