Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 NSR1YGR159C 1245 nt18.11■□□□□ 0.49
TY1A-NL1Q12391 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.86■□□□□ 0.45
TY1A-NL1Q12391 NOP1YDL014W 984 nt17.18■□□□□ 0.34
TY1A-NL1Q12391 MDJ1YFL016C 1536 nt16.5■□□□□ 0.23
TY1A-NL1Q12391 YKL036CYKL036C 393 nt15.45■□□□□ 0.06
TY1A-NL1Q12391 YJL027CYJL027C 417 nt15.18■□□□□ 0.02
TY1A-NL1Q12391 SRX1YKL086W 384 nt15.01□□□□□ -0.01
TY1A-NL1Q12391 Q0297Q0297 156 nt14.9□□□□□ -0.02
TY1A-NL1Q12391 DBP2YNL112W 1641 nt14.43□□□□□ -0.1
TY1A-NL1Q12391 YCR051WYCR051W 669 nt14.2□□□□□ -0.14
TY1A-NL1Q12391 YBR190WYBR190W 312 nt14.17□□□□□ -0.14
TY1A-NL1Q12391 SCS3YGL126W 1143 nt13.85□□□□□ -0.19
TY1A-NL1Q12391 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.85□□□□□ -0.19
TY1A-NL1Q12391 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.85□□□□□ -0.19
TY1A-NL1Q12391 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.85□□□□□ -0.19
TY1A-NL1Q12391 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.85□□□□□ -0.19
TY1A-NL1Q12391 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.85□□□□□ -0.19
TY1A-NL1Q12391 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.85□□□□□ -0.19
TY1A-NL1Q12391 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.85□□□□□ -0.19
TY1A-NL1Q12391 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.85□□□□□ -0.19
TY1A-NL1Q12391 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.85□□□□□ -0.19
TY1A-NL1Q12391 RTC3YHR087W 336 nt13.82□□□□□ -0.2
TY1A-NL1Q12391 CCC1YLR220W 969 nt13.66□□□□□ -0.22
TY1A-NL1Q12391 RVS167YDR388W 1449 nt13.47□□□□□ -0.25
TY1A-NL1Q12391 YOL085CYOL085C 342 nt13.4□□□□□ -0.26
TY1A-NL1Q12391 SSA3YBL075C 1950 nt13.38□□□□□ -0.27
TY1A-NL1Q12391 RPP1BYDL130W 321 nt13.37□□□□□ -0.27
TY1A-NL1Q12391 SCJ1YMR214W 1134 nt13.33□□□□□ -0.28
TY1A-NL1Q12391 PKP1YIL042C 1185 nt13.24□□□□□ -0.29
TY1A-NL1Q12391 PUT4YOR348C 1884 nt13.22□□□□□ -0.29
TY1A-NL1Q12391 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.94□□□□□ -0.34
TY1A-NL1Q12391 SHR5YOL110W 714 nt12.9□□□□□ -0.34
TY1A-NL1Q12391 ARE1YCR048W 1833 nt12.85□□□□□ -0.35
TY1A-NL1Q12391 PET122YER153C 765 nt12.83□□□□□ -0.36
TY1A-NL1Q12391 URN1YPR152C 1398 nt12.8□□□□□ -0.36
TY1A-NL1Q12391 POA1YBR022W 534 nt12.74□□□□□ -0.37
TY1A-NL1Q12391 SAH1YER043C 1350 nt12.72□□□□□ -0.37
TY1A-NL1Q12391 OPI9YLR338W 858 nt12.7□□□□□ -0.38
TY1A-NL1Q12391 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.68□□□□□ -0.38
TY1A-NL1Q12391 DEP1YAL013W 1218 nt12.65□□□□□ -0.38
TY1A-NL1Q12391 SCR1SCR1 522 nt12.57□□□□□ -0.4
TY1A-NL1Q12391 BSC6YOL137W 1494 nt12.57□□□□□ -0.4
TY1A-NL1Q12391 YDJ1YNL064C 1230 nt12.53□□□□□ -0.4
TY1A-NL1Q12391 RPN10YHR200W 807 nt12.51□□□□□ -0.41
TY1A-NL1Q12391 YNL208WYNL208W 600 nt12.43□□□□□ -0.42
TY1A-NL1Q12391 RRN5YLR141W 1092 nt12.39□□□□□ -0.43
TY1A-NL1Q12391 Q0182Q0182 405 nt12.37□□□□□ -0.43
TY1A-NL1Q12391 BUD23YCR047C 828 nt12.33□□□□□ -0.44
TY1A-NL1Q12391 PUN1YLR414C 792 nt12.33□□□□□ -0.44
TY1A-NL1Q12391 SPT5YML010W 3192 nt12.32□□□□□ -0.44
TY1A-NL1Q12391 GAR1YHR089C 618 nt12.3□□□□□ -0.44
TY1A-NL1Q12391 MOT3YMR070W 1473 nt12.27□□□□□ -0.44
TY1A-NL1Q12391 ATS1YAL020C 1002 nt12.25□□□□□ -0.45
TY1A-NL1Q12391 PTC2YER089C 1395 nt12.24□□□□□ -0.45
TY1A-NL1Q12391 YJR018WYJR018W 363 nt12.17□□□□□ -0.46
TY1A-NL1Q12391 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.16□□□□□ -0.46
TY1A-NL1Q12391 NAB2YGL122C 1578 nt12.15□□□□□ -0.46
TY1A-NL1Q12391 SSA4YER103W 1929 nt12.07□□□□□ -0.48
TY1A-NL1Q12391 RSB1YOR049C 1065 nt12.02□□□□□ -0.49
TY1A-NL1Q12391 FIS1YIL065C 468 nt11.97□□□□□ -0.49
TY1A-NL1Q12391 TIR1YER011W 765 nt11.92□□□□□ -0.5
TY1A-NL1Q12391 YJR120WYJR120W 351 nt11.92□□□□□ -0.5
TY1A-NL1Q12391 DAL1YIR027C 1383 nt11.92□□□□□ -0.5
TY1A-NL1Q12391 SSA1YAL005C 1929 nt11.87□□□□□ -0.51
TY1A-NL1Q12391 FPR4YLR449W 1179 nt11.86□□□□□ -0.51
TY1A-NL1Q12391 MEP2YNL142W 1500 nt11.84□□□□□ -0.51
TY1A-NL1Q12391 RPP2BYDR382W 333 nt11.82□□□□□ -0.52
TY1A-NL1Q12391 PHO4YFR034C 939 nt11.81□□□□□ -0.52
TY1A-NL1Q12391 INM2YDR287W 879 nt11.79□□□□□ -0.52
TY1A-NL1Q12391 YGR139WYGR139W 339 nt11.76□□□□□ -0.53
TY1A-NL1Q12391 YPS1YLR120C 1710 nt11.73□□□□□ -0.53
TY1A-NL1Q12391 BDF1YLR399C 2061 nt11.65□□□□□ -0.54
TY1A-NL1Q12391 DCW1YKL046C 1350 nt11.65□□□□□ -0.55
TY1A-NL1Q12391 YBL100CYBL100C 315 nt11.63□□□□□ -0.55
TY1A-NL1Q12391 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.62□□□□□ -0.55
TY1A-NL1Q12391 YDR095CYDR095C 411 nt11.59□□□□□ -0.55
TY1A-NL1Q12391 SRB2YHR041C 633 nt11.59□□□□□ -0.55
TY1A-NL1Q12391 BDH2YAL061W 1254 nt11.51□□□□□ -0.57
TY1A-NL1Q12391 TAT1YBR069C 1860 nt11.5□□□□□ -0.57
TY1A-NL1Q12391 EMI2YDR516C 1503 nt11.48□□□□□ -0.57
TY1A-NL1Q12391 FUN26YAL022C 1554 nt11.47□□□□□ -0.57
TY1A-NL1Q12391 YMR090WYMR090W 684 nt11.43□□□□□ -0.58
TY1A-NL1Q12391 PST2YDR032C 597 nt11.42□□□□□ -0.58
TY1A-NL1Q12391 YBR220CYBR220C 1683 nt11.41□□□□□ -0.58
TY1A-NL1Q12391 ALF1YNL148C 765 nt11.39□□□□□ -0.59
TY1A-NL1Q12391 YDL221WYDL221W 552 nt11.37□□□□□ -0.59
TY1A-NL1Q12391 PTP1YDL230W 1008 nt11.37□□□□□ -0.59
TY1A-NL1Q12391 RPP2AYOL039W 321 nt11.36□□□□□ -0.59
TY1A-NL1Q12391 TRM9YML014W 840 nt11.35□□□□□ -0.59
TY1A-NL1Q12391 CAC2YML102W 1407 nt11.35□□□□□ -0.59
TY1A-NL1Q12391 NME1NME1 340 nt11.32□□□□□ -0.6
TY1A-NL1Q12391 WWM1YFL010C 636 nt11.31□□□□□ -0.6
TY1A-NL1Q12391 SDH1YKL148C 1923 nt11.31□□□□□ -0.6
TY1A-NL1Q12391 CCT6YDR188W 1641 nt11.29□□□□□ -0.6
TY1A-NL1Q12391 LSM3YLR438C-A 270 nt11.27□□□□□ -0.61
TY1A-NL1Q12391 SIS1YNL007C 1059 nt11.23□□□□□ -0.61
TY1A-NL1Q12391 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.21□□□□□ -0.61
TY1A-NL1Q12391 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.21□□□□□ -0.61
TY1A-NL1Q12391 IRC15YPL017C 1500 nt11.19□□□□□ -0.62
TY1A-NL1Q12391 SCC4YER147C 1875 nt11.17□□□□□ -0.62
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