Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSM1Q08AH1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSM1Q08AH1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM1Q08AH1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSM1Q08AH1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms