Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SSRP1Q08945 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSRP1Q08945 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSRP1Q08945 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SSRP1Q08945 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms