Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE3AQ05086 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBE3AQ05086 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE3AQ05086 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE3AQ05086 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms