Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TAP1Q03518 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TAP1Q03518 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAP1Q03518 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TAP1Q03518 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAP1Q03518 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAP1Q03518 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAP1Q03518 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAP1Q03518 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAP1Q03518 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAP1Q03518 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAP1Q03518 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAP1Q03518 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAP1Q03518 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAP1Q03518 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAP1Q03518 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TAP1Q03518 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAP1Q03518 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAP1Q03518 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms