Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CREMQ03060 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CREMQ03060 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CREMQ03060 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CREMQ03060 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CREMQ03060 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CREMQ03060 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CREMQ03060 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CREMQ03060 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CREMQ03060 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CREMQ03060 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREMQ03060 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREMQ03060 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREMQ03060 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CREMQ03060 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CREMQ03060 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CREMQ03060 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREMQ03060 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREMQ03060 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREMQ03060 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CREMQ03060 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREMQ03060 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CREMQ03060 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
CREMQ03060 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREMQ03060 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREMQ03060 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREMQ03060 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREMQ03060 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREMQ03060 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREMQ03060 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREMQ03060 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CREMQ03060 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREMQ03060 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREMQ03060 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREMQ03060 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREMQ03060 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CREMQ03060 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CREMQ03060 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CREMQ03060 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CREMQ03060 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CREMQ03060 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CREMQ03060 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CREMQ03060 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREMQ03060 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREMQ03060 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREMQ03060 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREMQ03060 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CREMQ03060 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREMQ03060 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREMQ03060 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CREMQ03060 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREMQ03060 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREMQ03060 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CREMQ03060 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREMQ03060 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREMQ03060 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREMQ03060 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREMQ03060 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CREMQ03060 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CREMQ03060 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CREMQ03060 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CREMQ03060 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CREMQ03060 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CREMQ03060 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CREMQ03060 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREMQ03060 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREMQ03060 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREMQ03060 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREMQ03060 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREMQ03060 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREMQ03060 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREMQ03060 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CREMQ03060 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CREMQ03060 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CREMQ03060 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREMQ03060 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CREMQ03060 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREMQ03060 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREMQ03060 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CREMQ03060 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREMQ03060 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CREMQ03060 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CREMQ03060 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CREMQ03060 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREMQ03060 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREMQ03060 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CREMQ03060 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREMQ03060 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREMQ03060 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CREMQ03060 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CREMQ03060 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms