Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APBA1Q02410 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APBA1Q02410 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APBA1Q02410 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APBA1Q02410 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms