Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE1BQ01064 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDE1BQ01064 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE1BQ01064 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE1BQ01064 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms