Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP2R2BQ00005 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP2R2BQ00005 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP2R2BQ00005 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP2R2BQ00005 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms