Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX1P78414 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX1P78414 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX1P78414 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX1P78414 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX1P78414 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX1P78414 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX1P78414 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX1P78414 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX1P78414 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX1P78414 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX1P78414 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX1P78414 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX1P78414 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX1P78414 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX1P78414 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX1P78414 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX1P78414 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX1P78414 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX1P78414 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX1P78414 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX1P78414 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX1P78414 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX1P78414 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX1P78414 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX1P78414 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX1P78414 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX1P78414 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX1P78414 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX1P78414 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX1P78414 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX1P78414 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX1P78414 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX1P78414 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX1P78414 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX1P78414 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX1P78414 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX1P78414 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX1P78414 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX1P78414 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX1P78414 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX1P78414 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX1P78414 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX1P78414 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX1P78414 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX1P78414 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX1P78414 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX1P78414 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX1P78414 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX1P78414 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX1P78414 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX1P78414 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX1P78414 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX1P78414 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX1P78414 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX1P78414 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX1P78414 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX1P78414 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX1P78414 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX1P78414 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX1P78414 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX1P78414 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX1P78414 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX1P78414 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX1P78414 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX1P78414 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX1P78414 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX1P78414 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX1P78414 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX1P78414 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX1P78414 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX1P78414 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX1P78414 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX1P78414 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX1P78414 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX1P78414 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX1P78414 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX1P78414 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX1P78414 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX1P78414 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX1P78414 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX1P78414 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX1P78414 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX1P78414 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX1P78414 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX1P78414 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX1P78414 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX1P78414 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX1P78414 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX1P78414 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX1P78414 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX1P78414 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX1P78414 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX1P78414 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX1P78414 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRX1P78414 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRX1P78414 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRX1P78414 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRX1P78414 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRX1P78414 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms