Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
UBXN2AP68543 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBXN2AP68543 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBXN2AP68543 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBXN2AP68543 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBXN2AP68543 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms